角色选择直接影响通关效率和体验。漩涡鸣人系列忍者因其技能机制和适应性占据优势，尤其是第四尾形态和新春限定版本。这类角色拥有远程消耗能力，配合奥义流或技能强化路线可快速清场，同时容错率较高。宇智波佐助的天照、麒麟等技能虽然爆发力强，但对操作精度要求更高，适合熟悉连招节奏的玩家。
春野樱的千本樱和妖狐技能具备高爆发特性，但需依赖近战输出环境，在应对霸体首领时容易陷入被动。旗木卡卡西的写轮眼辅助效果突出，神威技能可创造输出窗口，但整体偏向团队协作，单人挑战时效率略逊于主攻型角色。医疗流推荐搭配帕克或蛤蟆龙作为通灵兽，前者提供视野控制，后者能减少技能冷却时间。
李洛克醉拳形态配合一拳流核心能力（岩落之拳、恢复之拳）可实现无伤连击，但需牺牲技能多样性。秘卷流派依赖土遁·土流枪或一字连柱的控制效果，适合佐助等需要输出环境的角色。须佐鼬作为隐藏首领的应对策略中，携带抓取技能的百豪樱能有效破解其霸体阶段，这是基于机制克制的典型设计。
资源管理环节需优先保证关键能力获取。幻之恩赐系统中的试炼币应优先解锁攻击强化分支，生命值提升在后期收益会递减。光门触发条件与无伤通关直接相关，建议在前三关集中资源提升输出能力。扭曲时空的隐藏关卡需同时击败黑白双人组，奖励虽丰厚但风险极高，需评估当前战力再选择挑战。
最终阶段面对忍界大战带土等首领时，位移技能和轴心走位至关重要。普攻流需保持Y轴移动规避地爆天星，奥义流则要预留查克拉应对第三阶段的人柱力干扰。称号获取并非单纯依赖数值碾压，对首领行为模式的预判和资源分配策略才是核心差异点。
